Flawonoidy, to podobnie jak wcześniej opisane terpeny związki chemiczne występujące w konopiach. W odróżnieniu od terpenów prozdrowotne właściwości flawonoidów zostały dobrze poznane. Flawonoidy działają przeciwutleniająco, przeciwzapalnie, przeciwgrzybicznie, rozkurczowo oraz wzmacniająco na układ krwionośny. W przypadku olejków CBD obecność flawonoidów wspomaga działanie naturalnych kannabinoidów.